Образует городской округ Красноперекопск (Красноперекопский горсовет) как единственный населённый пункт в его составе.
Город находится в южной части Перекопского перешейка, на берегу озера Старого к северу от крымской столицы Симферополя.
В Красноперекопске есть железнодорожный вокзал (линия Джанкой — Херсон) и автовокзал.
Автобусным сообщением город связан с Симферополем и другими населёнными пунктами Крыма, а также с рядом населённых пунктов Украины.
14 сентября 2016 года в Красноперекопске был открыт первый городской муниципальный автобусный маршрут от Бромного завода до Телевышки.