Наравне с Анапой является самым западным городом региона.
Город находится в 130 км к северо-западу от Краснодара.
Близ города, к северо-востоку от него, лежит Курчанский лиман.
При въезде в Темрюк, со стороны Краснодара, в районе 14-й остановки находится Гнилая гора, знаменитая большой колонией грязевых вулканов.
Город Темрюк, как и весь Краснодарский край, находится в часовом поясе, обозначаемом по международному стандарту как Moscow Time Zone (MSK).
Название города легло в основу географических названий: Темрюкский залив, банка Темрюкская и Темрюкский район.
В Темрюкском районе имеются Темрюкский морской порт, порт Тамань, порт Кавказ, терминал по перевалке сжиженного газа ООО «Мактрен-Нафта».
В городе имеется одноимённая железнодорожная станция (пассажирское движение отсутствует) и автостанция.
Городской транспорт представлен четырьмя маршрутами автобуса (№№ 1, 2, 4 и 9) и четырьмя линиями маршрутного такси (№ 6 Автовокзал — школа-Интернат, № 8 Автовокзал — 18 ост., № 10 Автовокзал — Новое Кладбище, № 11 Автовокзал — посёлок Правобережный).
В Темрюке имеется автовокзал, с которого можно доехать в Краснодар, Анапу, Тамань, Армавир и другие города России.
Ближайшие два железнодорожных вокзала расположены в 60 км от города:
В конце 2020 года из Музея Зальцбурга вернулись три античные амфоры и пять могильных барельефов, которые были вывезены в 1943 году немецким генералом горных войск Рудольфом Конрадом и затем подарены гауляйтеру Зальцбурга Густаву Адольфу Шеелю.